Glossaire

Ajustement gaussien

Ajustement d’une gaussienne (2D/3D) sur une PSF pour estimer les paramètres (position, amplitude, fond, largeur, etc.).

Correction de dérive

Estimation puis compensation de la dérive afin d’aligner les localisations (ou les images) dans un repère stable.

Dérive

Déplacement lent et global du champ d’observation au cours du temps (microscope, échantillon, stabilité mécanique/thermique), mesurable en \((x, y)\) et parfois en \(z\).

Image haute résolution

Image reconstruite à partir d’un ensemble de localisations (nuage de points) en appliquant un rendu (binning, gaussien, histogramme, etc.).

Localisation

Estimation de la position \((x, y)\) (et éventuellement \(z\)) d’une molécule unique à partir de son image (PSF), généralement par ajustement d’un modèle ou d’une PSF expérimentale.

Pipeline

Enchaînement reproductible d’étapes de traitement (prétraitement, localisation, filtrage, suivi, rendu, export), avec des paramètres sauvegardés.

PSF (Point Spread Function)

Réponse impulsionnelle optique du microscope. Elle décrit l’image formée par une source ponctuelle et conditionne la précision de localisation.

ROI (Region Of Interest)

Sous-région d’une image extraite autour d’une zone d’intérêt (ex. autour d’un maximum local) pour effectuer un traitement local (seuillage, fit, etc.).

Seuil (Threshold)

Valeur limite utilisée pour discriminer un signal (pixels/objets) du fond. Peut être fixe, automatique, ou dépendre d’un modèle de bruit.

SNR (Signal-to-Noise Ratio)

Rapport signal sur bruit, indicateur de la qualité d’un signal mesuré. Un SNR faible dégrade la précision de localisation et augmente le risque de faux positifs.

Suivi

Association des localisations d’une même molécule au fil des frames afin de former une trajectoire (track).

Watershed

Méthode de segmentation basée sur la topographie d’une image (analogie « bassin versant »), souvent utilisée pour séparer des objets proches.