Test Report Main Computer
Environnement
Python |
3.13.2 |
Platform |
Windows-11-10.0.26100-SP0 |
JAVA_HOME |
C:Program FilesOpenJDKjdk-22.0.2 |
System |
Windows |
CPU |
Unknown Processor (2.2 GHz - 24 Cores (32 Logical)) |
RAM |
63.69 GB |
GPU |
NVIDIA GeForce RTX 4090 Laptop GPU (Memory: 16376 MB) |
Summary
96 tests collected, 96 passed ✅, 0 failed ❌ in 0:00:35s on 02/05/2025 at 12:00:16
Monitoring
Test Cases
Palmtracer
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Process No Input |
✅ |
1.39s |
Process Nothing |
✅ |
130ms |
Process Multiple Stack |
✅ |
122ms |
Process Only Localization |
✅ |
156ms |
Process Only Tracking |
✅ |
129ms |
Process Only Visualization Hr |
✅ |
136ms |
Process Only Visualization Graph |
✅ |
1.06s |
Process Only Gallery |
✅ |
116ms |
Process All |
✅ |
3.11s |
Process Filter Plan |
✅ |
118ms |
Process Filter All |
✅ |
203ms |
Log Test : Process No Input
Aucun fichier.
Log Test : Process Nothing
[02-05-2025 11:59:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
[02-05-2025 11:59:44] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:44] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:44] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:44] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
[02-05-2025 11:59:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
[02-05-2025 11:59:44] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:44] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:44] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:44] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation haute résolution activée.
[02-05-2025 11:59:44] Aucun fichier de localisation pour la visualisation.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation graphique activée.
[02-05-2025 11:59:44] Génération de la galerie activée.
[02-05-2025 11:59:44] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
Log Test : Process Multiple Stack
[02-05-2025 11:59:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
[02-05-2025 11:59:44] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:44] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:44] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:44] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
[02-05-2025 11:59:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_quadrant_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
[02-05-2025 11:59:44] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_quadrant_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:44] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:44] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:44] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 11:59:44] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_quadrant_PALM_Tracer/log-20250205_115944.log
Log Test : Process Only Localization
[02-05-2025 11:59:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
[02-05-2025 11:59:45] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:45] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:45] Localisation activée.
Log Test : Process Only Tracking
[02-05-2025 11:59:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
[02-05-2025 11:59:45] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:45] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:45] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:45] Tracking activé.
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement du fichier de tracking.
[02-05-2025 11:59:45] 455 tracking(s) trouvé(s).
[02-05-2025 11:59:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 11:59:45] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 11:59:45] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 11:59:45] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
Log Test : Process Only Visualization Hr
[02-05-2025 11:59:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
[02-05-2025 11:59:45] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:45] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:45] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:45] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:45] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:45] 455 tracking(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:45] Visualisation haute résolution activée.
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Integrated Intensity).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma X).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma Y).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Circularity).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Theta).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Gaussian).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Z).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Z).
[02-05-2025 11:59:45] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 11:59:45] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 11:59:45] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
Log Test : Process Only Visualization Graph
[02-05-2025 11:59:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
[02-05-2025 11:59:45] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:45] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:45] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:45] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:45] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:45] 455 tracking(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 11:59:45] Visualisation graphique activée.
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Integrated Intensity).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Integrated Intensity).
[02-05-2025 11:59:45] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Integrated Intensity).
[02-05-2025 11:59:45] Annulation de la visualisation graphique : Sigma X uniforme.
[02-05-2025 11:59:45] Annulation de la visualisation graphique : Sigma Y uniforme.
[02-05-2025 11:59:45] Annulation de la visualisation graphique : Circularity uniforme.
[02-05-2025 11:59:45] Annulation de la visualisation graphique : Theta uniforme.
[02-05-2025 11:59:46] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, MSE Gaussian).
[02-05-2025 11:59:46] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, MSE Gaussian).
[02-05-2025 11:59:46] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, MSE Gaussian).
[02-05-2025 11:59:46] Annulation de la visualisation graphique : Z uniforme.
[02-05-2025 11:59:46] Annulation de la visualisation graphique : MSE Z uniforme.
[02-05-2025 11:59:46] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 11:59:46] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:46] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115945.log
Log Test : Process Only Gallery
[02-05-2025 11:59:46] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115946.log
[02-05-2025 11:59:46] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:46] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:46] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:46] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:46] Localisation désactivé.
[02-05-2025 11:59:46] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:46] 455 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:46] Tracking désactivé.
[02-05-2025 11:59:46] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[02-05-2025 11:59:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20250205_115945.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 11:59:46] 455 tracking(s) trouvée(s).
[02-05-2025 11:59:46] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 11:59:46] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 11:59:46] Génération de la galerie activée.
[02-05-2025 11:59:46] Enregistrement de la galerie ({'ROI Size': 9, 'ROIs Per Line': 30}).
[02-05-2025 11:59:46] Traitement terminé.
[02-05-2025 11:59:46] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115946.log
Log Test : Process All
[02-05-2025 11:59:46] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115946.log
[02-05-2025 11:59:46] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:46] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:46] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:46] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:46] Localisation activée.
Log Test : Process Filter Plan
[02-05-2025 11:59:49] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115949.log
[02-05-2025 11:59:49] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:49] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:49] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:49] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:49] Localisation activée.
Log Test : Process Filter All
[02-05-2025 11:59:49] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_115949.log
[02-05-2025 11:59:49] Commencer le traitement.
[02-05-2025 11:59:49] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 11:59:49] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 11:59:49] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 11:59:49] Localisation activée.
Processing Gallery
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Make Gallery |
✅ |
9ms |
Processing Palm
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Palm Cpu Image |
✅ |
545ms |
Palm Cpu Stack |
✅ |
2.38s |
Palm Cpu Stack Plane Selection |
✅ |
21ms |
Palm Cpu Stack Dll Check Quadrant |
✅ |
183ms |
Cpu Auto Threshold |
✅ |
158ms |
Log Test : Palm Cpu Image
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_0_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_1_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_2_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_3_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_4_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Log Test : Palm Cpu Stack
Log Test : Palm Cpu Stack Plane Selection
Log Test : Palm Cpu Stack Dll Check Quadrant
Processing Parsing
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Rearrange Dataframe Columns |
✅ |
2ms |
Processing Tracking
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Tracking |
✅ |
2.64s |
Log Test : Tracking
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_0_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 224 Points comparés, 224 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_1_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 223 Points comparés, 223 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_2_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 224 Points comparés, 224 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_3_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 223 Points comparés, 223 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_4_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 224 Points comparés, 224 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_0_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 214 Points comparés, 214 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_1_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 211 Points comparés, 211 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_2_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 216 Points comparés, 216 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_3_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 213 Points comparés, 213 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_4_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 216 Points comparés, 216 Points identiques (100.00%)
Processing Visualization
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Normalize Data |
✅ |
1ms |
Render Hr Image |
✅ |
14ms |
Render Hr Image Bad Input |
✅ |
2ms |
Render Roi |
✅ |
30ms |
Render Roi Bad Input |
✅ |
1ms |
Plot Histogram |
✅ |
650ms |
Plot Histogram Bad Input |
✅ |
96ms |
Plot Violin |
✅ |
557ms |
Plot Violin Bad Input |
✅ |
50ms |
Plot Heatmap |
✅ |
274ms |
Plot Heatmap Bad Input |
✅ |
55ms |
Settings Groups
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Base Group |
✅ |
67ms |
Batch |
✅ |
68ms |
Batch Get Path |
✅ |
77ms |
Batch Get Stacks |
✅ |
72ms |
Calibration |
✅ |
70ms |
Localization |
✅ |
81ms |
Gaussian Fit |
✅ |
69ms |
Spline Fit |
✅ |
68ms |
Tracking |
✅ |
70ms |
Gallery |
✅ |
70ms |
Visualization Hr |
✅ |
79ms |
Visualization Graph |
✅ |
73ms |
Filtering |
✅ |
78ms |
Filtering Gf |
✅ |
78ms |
Filtering T |
✅ |
74ms |
Log Test : Batch
- Activate : True
- Files : -1
- Mode : 0
{'Files': -1, 'Mode': 0}
Log Test : Calibration
- Activate : True
- Pixel Size : 320
- Exposure : 50
- Intensity : 0.012
{'Pixel Size': 320, 'Exposure': 50, 'Intensity': 0.012}
Log Test : Localization
- Activate : True
- Preview : True
- Threshold : 90.0
- Auto Threshold : True
- ROI Size : 7
- Watershed : True
- Mode : 0
- Gaussian Fit :
- Activate : True
- Mode : 1
- Sigma : 1.0
- Theta : 0.0
- Spline Fit :
- Activate : True
- Peak : 1.0
- Cut-Off : 1.0
{'Preview': True, 'Threshold': 90.0, 'Auto Threshold': True, 'ROI Size': 7, 'Watershed': True, 'Mode': 0, 'Gaussian Fit Mode': 1, 'Gaussian Fit Sigma': 1.0, 'Gaussian Fit Theta': 0.0, 'Spline Fit Peak': 1.0, 'Spline Fit Cut-Off': 1.0}
Log Test : Gaussian Fit
- Activate : True
- Mode : 2
- Sigma : 1.0
- Theta : 0.0
{'Mode': 2, 'Sigma': 1.0, 'Theta': 0.0}
Log Test : Spline Fit
- Activate : True
- Peak : 2.0
- Cut-Off : 1.0
{'Peak': 2.0, 'Cut-Off': 1.0}
Log Test : Tracking
- Activate : True
- Max Distance : 2.0
- Min Length : 1
- Decrease : 10.0
- Cost Birth : 0.5
{'Max Distance': 2.0, 'Min Length': 1, 'Decrease': 10.0, 'Cost Birth': 0.5}
Log Test : Gallery
- Activate : True
- ROI Size : 11
- ROIs Per Line : 30
{'ROI Size': 11, 'ROIs Per Line': 30}
Log Test : Visualization Hr
- Activate : True
- Ratio : 1
- Source : 0
{'Ratio': 1, 'Source': 0}
Log Test : Visualization Graph
- Activate : True
- Mode : 1
- Source : 0
{'Mode': 1, 'Source': 0}
Log Test : Filtering
- Activate : True
- Plane : [2, 3]
- Intensity : [1, 100]
- Gaussian Fit :
- Activate : True
- MSE Gaussian : [0.0, 1.0]
- Sigma X : [0.0, 1.0]
- Sigma Y : [0.0, 1.0]
- Theta : [-1.0, 1.0]
- Circularity : [0.0, 1.0]
- Z : [-1.0, 1.0]
- Tracks :
- Activate : True
- Length : [1, 100]
- D Coeff : [0, 10]
- Instant D : [0, 10]
- Speed : [0.0, 1.0]
- Alpha : [-1.0, 1.0]
- Confinement : [-1.0, 1.0]
{'Plane': [2, 3], 'Intensity': [1, 100], 'Gaussian Fit MSE Gaussian': [0.0, 1.0], 'Gaussian Fit Sigma X': [0.0, 1.0], 'Gaussian Fit Sigma Y': [0.0, 1.0], 'Gaussian Fit Theta': [-1.0, 1.0], 'Gaussian Fit Circularity': [0.0, 1.0], 'Gaussian Fit Z': [-1.0, 1.0], 'Tracks Length': [1, 100], 'Tracks D Coeff': [0, 10], 'Tracks Instant D': [0, 10], 'Tracks Speed': [0.0, 1.0], 'Tracks Alpha': [-1.0, 1.0], 'Tracks Confinement': [-1.0, 1.0]}
Log Test : Filtering Gf
- Activate : True
- MSE Gaussian : [1.0, 2.0]
- Sigma X : [0.0, 1.0]
- Sigma Y : [0.0, 1.0]
- Theta : [-1.0, 1.0]
- Circularity : [0.0, 1.0]
- Z : [-1.0, 1.0]
{'MSE Gaussian': [1.0, 2.0], 'Sigma X': [0.0, 1.0], 'Sigma Y': [0.0, 1.0], 'Theta': [-1.0, 1.0], 'Circularity': [0.0, 1.0], 'Z': [-1.0, 1.0]}
Log Test : Filtering T
- Activate : True
- Length : [2, 3]
- D Coeff : [0, 10]
- Instant D : [0, 10]
- Speed : [0.0, 1.0]
- Alpha : [-1.0, 1.0]
- Confinement : [-1.0, 1.0]
{'Length': [2, 3], 'D Coeff': [0, 10], 'Instant D': [0, 10], 'Speed': [0.0, 1.0], 'Alpha': [-1.0, 1.0], 'Confinement': [-1.0, 1.0]}
Settings Settings
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Settings |
✅ |
84ms |
Settings Group Getter |
✅ |
73ms |
Log Test : Settings
Settings :
- Batch :
- Activate : True
- Files : -1
- Mode : 0
- Calibration :
- Activate : True
- Pixel Size : 320
- Exposure : 50
- Intensity : 0.012
- Localization :
- Activate : False
- Preview : True
- Threshold : 90.0
- Auto Threshold : True
- ROI Size : 7
- Watershed : True
- Mode : 0
- Gaussian Fit :
- Activate : True
- Mode : 1
- Sigma : 1.0
- Theta : 0.0
- Spline Fit :
- Activate : True
- Peak : 1.0
- Cut-Off : 1.0
- Tracking :
- Activate : False
- Max Distance : 5.0
- Min Length : 1
- Decrease : 10.0
- Cost Birth : 0.5
- Gallery :
- Activate : False
- ROI Size : 9
- ROIs Per Line : 30
- VisualizationHR :
- Activate : False
- Ratio : 2
- Source : 0
- VisualizationGraph :
- Activate : False
- Mode : 0
- Source : 0
- Filtering :
- Activate : True
- Plane : [1, 100]
- Intensity : [1, 100]
- Gaussian Fit :
- Activate : True
- MSE Gaussian : [0.0, 1.0]
- Sigma X : [0.0, 1.0]
- Sigma Y : [0.0, 1.0]
- Theta : [-1.0, 1.0]
- Circularity : [0.0, 1.0]
- Z : [-1.0, 1.0]
- Tracks :
- Activate : True
- Length : [1, 100]
- D Coeff : [0, 10]
- Instant D : [0, 10]
- Speed : [0.0, 1.0]
- Alpha : [-1.0, 1.0]
- Confinement : [-1.0, 1.0]
Settings Types
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Base Setting |
✅ |
1ms |
Create Setting From Dict |
✅ |
71ms |
Create Setting From Dict Fail |
✅ |
73ms |
Spin Int |
✅ |
68ms |
Spin Float |
✅ |
71ms |
Check Box |
✅ |
74ms |
Combo |
✅ |
68ms |
Browse File |
✅ |
221ms |
File List |
✅ |
69ms |
Check Range Int |
✅ |
70ms |
Check Range Float |
✅ |
77ms |
Button |
✅ |
70ms |
Tools Fileio
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Save Json |
✅ |
1ms |
Open Json |
✅ |
1ms |
Open Json Bad File |
✅ |
1ms |
Save Tif |
✅ |
6ms |
Save Tif 2D |
✅ |
5ms |
Save Tif Bad Stack |
✅ |
1ms |
Open Tif |
✅ |
8ms |
Open Tif Bad File |
✅ |
1ms |
Save Png |
✅ |
5ms |
Save Png Bad Sample |
✅ |
1ms |
Tools Logger
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Logger |
✅ |
2ms |
Logger Bad Use |
✅ |
1ms |
Log Test : Logger
[02-05-2025 12:00:00] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\output/test_logger.log
[02-05-2025 12:00:00] First message
[02-05-2025 12:00:00]
[02-05-2025 12:00:00] after blank
[02-05-2025 12:00:00] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\output/test_logger.log
Log Test : Logger Bad Use
[02-05-2025 12:00:00] Aucun fichier à fermer.
[02-05-2025 12:00:00] Message without logger open
[02-05-2025 12:00:00] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
Tools Monitoring
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Monitoring |
✅ |
1.33s |
Monitoring Save |
✅ |
8.58s |
Log Test : Monitoring
6 entrées.
Timestamps : [0.0, 0.21, 0.42, 0.63, 0.84, 1.01]
CPU Usage : [0.0, 0.0, 0.4875, 0.0, 0.4875, 0.0]
GPU Usage : [10, 10, 10, 10, 10, 45]
Memory Usage : [744.8203125, 744.8203125, 744.8203125, 744.8203125, 744.8203125, 744.8828125]
Disk Usage : [0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0]
Log Test : Monitoring Save
Simulating high CPU usage for 2 seconds...
CPU simulation complete.
Simulating GPU usage for 2 seconds with matrix size 4096x4096...
GPU simulation complete.
Allocating 50 MB of memory...
Memory allocated. Holding for 2 seconds...
Releasing memory.
Writing a file of size 1 MB...
File written. Holding for 2 seconds...
Deleting the file...
Disk I/O simulation complete.
Kaleido doesn't work so well need update. No Image Saved.
Tools Utils
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Add Extension |
✅ |
1ms |
Add Suffix |
✅ |
1ms |
Get Timestamp For Files |
✅ |
1ms |
Get Last File |
✅ |
1ms |
Load Dll |
✅ |
2ms |
Print Error |
✅ |
1ms |
Print Warning |
✅ |
1ms |
Print Success |
✅ |
1ms |
Format Time |
✅ |
1ms |
Log Test : Get Timestamp For Files
Timestamp with hour : 20250502_120009
Timestamp without hour : 20250502
Log Test : Load Dll
Impossible de charger la DLL 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\DLL\File_PALM.dll':
Could not find module 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\DLL\File_PALM.dll' (or one of its dependencies). Try using the full path with constructor syntax.
Log Test : Print Error
Message d'erreur
Log Test : Print Warning
Message d'avertissement
Log Test : Print Success
Message de succes
Ui Highresviewer
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
High Res View |
✅ |
82ms |
High Res View Load |
✅ |
79ms |
High Res View Check Ratio |
✅ |
79ms |
High Res View Adjust Window Size |
✅ |
72ms |
High Res View Wheel |
✅ |
77ms |
High Res View Resize |
✅ |
70ms |
Widget
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
718ms |
Widget Reset Layer |
✅ |
864ms |
Widget Add Detection Layers |
✅ |
1.16s |
Widget Preview |
✅ |
732ms |
Widget Auto Threshold |
✅ |
834ms |
Widget Process |
✅ |
530ms |
Widget Bad Dll |
✅ |
487ms |
Widget Show High Res |
✅ |
586ms |
Log Test : Widget Reset Layer
Aucun fichier sélectionné.
Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Log Test : Widget Add Detection Layers
Aucun point détecté, les calques ne seront pas créés.
Aucun fichier en preview.
Log Test : Widget Preview
Aucun fichier en preview.
Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Preview des 46 points détectés.
Log Test : Widget Auto Threshold
Aucun fichier en preview.
Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Auto Threshold : 62.47488806831391
Log Test : Widget Process
Aucun fichier en preview.
Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
[02-05-2025 12:00:15] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_120015.log
[02-05-2025 12:00:15] Commencer le traitement.
[02-05-2025 12:00:15] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 12:00:15] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 12:00:15] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 12:00:15] Localisation désactivé.
[02-05-2025 12:00:15] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 12:00:15] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115949.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 12:00:15] 363 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 12:00:15] Tracking désactivé.
[02-05-2025 12:00:15] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[02-05-2025 12:00:15] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20250205_115946.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 12:00:15] 455 tracking(s) trouvée(s).
[02-05-2025 12:00:15] Visualisation haute résolution désactivée.
[02-05-2025 12:00:15] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 12:00:15] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 12:00:15] Traitement terminé.
[02-05-2025 12:00:15] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_120015.log
Log Test : Widget Bad Dll
Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Process non effectué car DLL manquantes.
Log Test : Widget Show High Res
Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
[02-05-2025 12:00:16] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_120016.log
[02-05-2025 12:00:16] Commencer le traitement.
[02-05-2025 12:00:16] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 12:00:16] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 12:00:16] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 12:00:16] Localisation désactivé.
[02-05-2025 12:00:16] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 12:00:16] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115949.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 12:00:16] 363 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 12:00:16] Tracking désactivé.
[02-05-2025 12:00:16] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[02-05-2025 12:00:16] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20250205_115946.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 12:00:16] 455 tracking(s) trouvée(s).
[02-05-2025 12:00:16] Visualisation haute résolution activée.
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Integrated Intensity).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma X).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma Y).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Circularity).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Theta).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Gaussian).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Z).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Z).
[02-05-2025 12:00:16] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 12:00:16] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 12:00:16] Traitement terminé.
[02-05-2025 12:00:16] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_120016.log
[02-05-2025 12:00:16] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_120016.log
[02-05-2025 12:00:16] Commencer le traitement.
[02-05-2025 12:00:16] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[02-05-2025 12:00:16] Paramètres sauvegardés.
[02-05-2025 12:00:16] Fichier Meta sauvegardé.
[02-05-2025 12:00:16] Localisation désactivé.
[02-05-2025 12:00:16] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[02-05-2025 12:00:16] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20250205_115949.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 12:00:16] 363 localisation(s) trouvée(s).
[02-05-2025 12:00:16] Tracking désactivé.
[02-05-2025 12:00:16] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[02-05-2025 12:00:16] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20250205_115946.csv' chargé avec succès.
[02-05-2025 12:00:16] 455 tracking(s) trouvée(s).
[02-05-2025 12:00:16] Visualisation haute résolution activée.
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Integrated Intensity).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma X).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma Y).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Circularity).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Theta).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Gaussian).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Z).
[02-05-2025 12:00:16] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Z).
[02-05-2025 12:00:16] Visualisation graphique désactivée.
[02-05-2025 12:00:16] Génération de la galerie désactivée.
[02-05-2025 12:00:16] Traitement terminé.
[02-05-2025 12:00:16] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20250205_120016.log
Test Report Big Data
Summary
3 tests collected, 3 passed ✅, 0 failed ❌ in 0:10:01s on 02/05/2025 at 12:16:54
Monitoring
Test Cases
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Palm Cpu |
✅ |
2min 38s |
Palm Gpu |
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2min 38s |
Tracking |
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4min 45s |