Test Report Main Computer
Environnement
Python |
3.13.9 |
Platform |
Windows-11-10.0.26200-SP0 |
JAVA_HOME |
C:Program FilesOpenJDKjdk-25 |
System |
Windows |
CPU |
13th Gen Intel(R) Core(TM) i9-13950HX (2.20 GHz - 24 Cores (32 Logical)) |
RAM |
63.69 GB |
GPU |
NVIDIA GeForce RTX 4090 Laptop GPU (Memory: 16376 MB) |
Summary
194 tests collected, 194 passed ✅, 0 failed ❌, 0 skipped ⏭️ in 0:01:23s on 27/01/2026 at 14:43:01
Monitoring
Test Cases
Palmtracer
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Getter Localization |
✅ |
238ms |
Getter Tracks |
✅ |
125ms |
Getter Tracks Compute |
✅ |
160ms |
Reset Result |
✅ |
146ms |
Reset Filtered |
✅ |
181ms |
Update Filtered |
✅ |
424ms |
Load Bad Dll |
✅ |
150ms |
Load Nothing |
✅ |
343ms |
Load |
✅ |
224ms |
Process No Input |
✅ |
133ms |
Process Nothing |
✅ |
204ms |
Process Bad Dll |
✅ |
121ms |
Process Multiple Stack |
✅ |
160ms |
Process Only Localization |
✅ |
219ms |
Process Only Localization Spline Bad |
✅ |
167ms |
Process Only Localization Spline |
✅ |
211ms |
Process Only Tracking |
✅ |
301ms |
Process Only Tracking Blinking |
✅ |
349ms |
Process Only Tracks Compute |
✅ |
588ms |
Process Only Visualization Hr |
✅ |
329ms |
Process Only Visualization Graph |
✅ |
735ms |
Process Only Gallery |
✅ |
170ms |
Process All |
✅ |
4.27s |
Process Filter Plan |
✅ |
161ms |
Process Filter All Localization |
✅ |
227ms |
Process Filter All Tracking |
✅ |
682ms |
Process Filter All Tracks Compute |
✅ |
750ms |
Process Filter Outside |
✅ |
151ms |
Add Color |
✅ |
174ms |
Log Test : Update Filtered
[27-01-2026 14:41:42] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144142.log
[27-01-2026 14:41:42] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:42] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:42] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:42] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:42] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:42] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:42] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:42] Enregistrement du fichier de localisation filtré
[27-01-2026 14:41:42] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:42] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:42] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:42] Enregistrement du fichier de trajectoires filtré
[27-01-2026 14:41:42] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:42] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:42] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:42] Enregistrement du fichier de trajectoires filtré
[27-01-2026 14:41:42] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:42] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:42] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:42] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:42] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:42] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144142.log
Log Test : Load Bad Dll
Process non effectué car DLL manquantes.
Log Test : Load Nothing
Aucun fichier de paramètres valide à charger.
Log Test : Load
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:43] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:43] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:43] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
Chargement du fichier de configuration 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\settings-20260127_144143.json'.
Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/localizations-20260127_144143.csv' chargé avec succès.
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/localizations_filtered-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/localizations_filtered-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking-reconnected-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking-reconnected-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered_reconnected-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered_reconnected-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD_filtered-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD_filtered-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit-20260127_144143.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit_filtered-20260127_144143.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit_filtered-20260127_144143.csv'
Pile chargé avec succès (taille : (10, 128, 256)).
Log Test : Process No Input
Aucun fichier.
Log Test : Process Nothing
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution activée.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pour la visualisation.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique activée.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pour la visualisation de graphiques.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie activée.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pour la génération d'une galerie.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution activée.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de trajectoires pour la visualisation.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique activée.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pour la visualisation de graphiques.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie activée.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pour la génération d'une galerie.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires activé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking calculée, aucun calcul supplémentaire ne peut être effectué.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation calculée, aucun calcul supplémentaire ne peut être effectué.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
Log Test : Process Bad Dll
Process non effectué car DLL manquantes.
Log Test : Process Multiple Stack
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:43] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:43] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:43] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:43] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:43] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:43] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_quadrant_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
[27-01-2026 14:41:43] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:43] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_quadrant_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:44] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:44] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:44] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:44] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:44] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_quadrant_PALM_Tracer/log-20260127_144143.log
Log Test : Process Only Localization
[27-01-2026 14:41:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
[27-01-2026 14:41:44] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:44] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:44] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:44] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:44] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:44] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:44] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:44] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
Log Test : Process Only Localization Spline Bad
[27-01-2026 14:41:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
[27-01-2026 14:41:44] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:44] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:44] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:44] Localisation activée.
Log Test : Process Only Localization Spline
[27-01-2026 14:41:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
[27-01-2026 14:41:44] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:44] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:44] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:44] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:44] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:44] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:44] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:44] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
Log Test : Process Only Tracking
[27-01-2026 14:41:44] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
[27-01-2026 14:41:44] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:44] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:44] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:44] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:44] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:44] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144144.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:44] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:44] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:44] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:44] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:44] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:44] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:44] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144144.log
Log Test : Process Only Tracking Blinking
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:45] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:45] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144144.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:45] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:45] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:45] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:45] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
Log Test : Process Only Tracks Compute
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:45] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:45] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144144.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Calcul sur les trajectoires activé.
[27-01-2026 14:41:45] Aucune métrique de sélectionnée, aucun calcul supplémentaire ne peut être effectué.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:45] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:45] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144144.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Calcul sur les trajectoires activé.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de calcul des MSD.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:45] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:45] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144144.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:45] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Calcul sur les trajectoires activé.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:45] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:45] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:45] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:45] Calcul sur les trajectoires activé.
[27-01-2026 14:41:45] Aucune donnée de tracking calculée, aucun calcul supplémentaire ne peut être effectué.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:45] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:45] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:45] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:45] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:45] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:45] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:45] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:45] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:45] Calcul sur les trajectoires activé.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées.
[27-01-2026 14:41:45] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:45] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:45] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
Log Test : Process Only Visualization Hr
[27-01-2026 14:41:45] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:45] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:45] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:46] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:46] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:46] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:46] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:46] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:46] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Visualisation haute résolution activée.
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma X).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Sigma Y).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Circularity).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Theta).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE XY).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Z).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, MSE Z).
[27-01-2026 14:41:46] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:46] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:46] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:46] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144145.log
[27-01-2026 14:41:46] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144146.log
[27-01-2026 14:41:46] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:46] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:46] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:46] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:46] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:46] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:46] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:46] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Visualisation haute résolution activée.
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation des trajectoires haute résolution (x2, Track Number).
[27-01-2026 14:41:46] Calcul sur les trajectoires à effectuer pour définir une couleur lors de la visualisation.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation des trajectoires haute résolution (x2, Length).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation des trajectoires haute résolution (x2, Instant D).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation des trajectoires haute résolution (x2, MSD).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation des trajectoires haute résolution (x2, Total Intensity).
[27-01-2026 14:41:46] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:46] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:46] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:46] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144146.log
Log Test : Process Only Visualization Graph
[27-01-2026 14:41:46] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144146.log
[27-01-2026 14:41:46] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:46] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:46] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:46] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:46] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:46] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:46] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:46] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:46] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:46] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:46] Visualisation graphique activée.
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:46] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : Sigma X uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : Sigma Y uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : Circularity uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : Theta uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : MSE XY uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : Z uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Annulation de la visualisation graphique : MSE Z uniforme.
[27-01-2026 14:41:46] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:46] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:46] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144146.log
Log Test : Process Only Gallery
[27-01-2026 14:41:47] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144147.log
[27-01-2026 14:41:47] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:47] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:47] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:47] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:47] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:41:47] Chargement d'une localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:47] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\localizations-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:47] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:47] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:47] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:47] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144145.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:47] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:47] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:47] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:47] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:47] Génération de la galerie activée.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement de la galerie ({'ROI Size': 9, 'ROIs Per Line': 30}).
[27-01-2026 14:41:47] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:47] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144147.log
Log Test : Process All
[27-01-2026 14:41:47] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144147.log
[27-01-2026 14:41:47] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:47] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:47] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:47] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:47] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:47] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:47] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:47] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:47] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:47] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:47] Calcul sur les trajectoires activé.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement du fichier de calcul des MSD.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:47] Filtrage du fichier de calcul sur trajectoires 8 trajectoires au lieu de 104 : 96 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:47] Visualisation haute résolution activée.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement de la visualisation haute résolution (x2, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:47] Visualisation graphique activée.
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:47] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Integrated Intensity).
[27-01-2026 14:41:48] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Sigma X).
[27-01-2026 14:41:48] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Sigma X).
[27-01-2026 14:41:48] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Sigma X).
[27-01-2026 14:41:48] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Sigma Y).
[27-01-2026 14:41:48] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Sigma Y).
[27-01-2026 14:41:49] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Sigma Y).
[27-01-2026 14:41:49] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Circularity).
[27-01-2026 14:41:49] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Circularity).
[27-01-2026 14:41:49] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Circularity).
[27-01-2026 14:41:49] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, Theta).
[27-01-2026 14:41:49] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, Theta).
[27-01-2026 14:41:50] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, Theta).
[27-01-2026 14:41:50] Enregistrement de la visualisation graphique (Histogram, MSE XY).
[27-01-2026 14:41:50] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Heat Map, MSE XY).
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement de la visualisation graphique (Plane Violin, MSE XY).
[27-01-2026 14:41:51] Annulation de la visualisation graphique : Z uniforme.
[27-01-2026 14:41:51] Annulation de la visualisation graphique : MSE Z uniforme.
[27-01-2026 14:41:51] Génération de la galerie activée.
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement de la galerie ({'ROI Size': 9, 'ROIs Per Line': 30}).
[27-01-2026 14:41:51] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:51] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144147.log
Log Test : Process Filter Plan
[27-01-2026 14:41:51] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
[27-01-2026 14:41:51] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:51] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:51] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:51] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:51] 96 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:51] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144147.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:51] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:51] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:51] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
Log Test : Process Filter All Localization
[27-01-2026 14:41:51] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
[27-01-2026 14:41:51] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:51] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:51] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:51] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:51] 414 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Filtrage du fichier de localisation 0 localisations au lieu de 414 : 414 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:51] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:51] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144147.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:51] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:51] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:51] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
[27-01-2026 14:41:51] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
[27-01-2026 14:41:51] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:51] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:51] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:51] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:51] 414 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Filtrage du fichier de localisation 0 localisations au lieu de 414 : 414 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement du fichier de localisation filtré
[27-01-2026 14:41:51] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:41:51] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-reconnected-20260127_144147.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:41:51] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:51] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:51] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:51] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
Log Test : Process Filter All Tracking
[27-01-2026 14:41:51] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
[27-01-2026 14:41:51] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:51] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:51] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:51] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:51] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:51] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:51] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:51] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:52] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:52] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144151.log
[27-01-2026 14:41:52] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144152.log
[27-01-2026 14:41:52] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:52] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:52] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:52] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:52] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:52] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:52] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de trajectoires 0 points au lieu de 455 : 455 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de trajectoires 143 points au lieu de 455 : 312 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:41:52] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:52] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144152.log
Log Test : Process Filter All Tracks Compute
[27-01-2026 14:41:52] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144152.log
[27-01-2026 14:41:52] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:52] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:52] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:52] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:52] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:52] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:52] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de trajectoires 0 points au lieu de 455 : 455 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de trajectoires 143 points au lieu de 455 : 312 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Calcul sur les trajectoires activé.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de calcul des MSD.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de calcul sur trajectoires 14 trajectoires au lieu de 39 : 25 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:52] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:52] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144152.log
[27-01-2026 14:41:52] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144152.log
[27-01-2026 14:41:52] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:52] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:52] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:52] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:52] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:52] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de localisation filtré
[27-01-2026 14:41:52] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de trajectoires 0 points au lieu de 455 : 455 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires filtré
[27-01-2026 14:41:52] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:52] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:52] Filtrage du fichier de trajectoires 143 points au lieu de 455 : 312 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de trajectoires filtré
[27-01-2026 14:41:52] Calcul sur les trajectoires activé.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de calcul des MSD.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées.
[27-01-2026 14:41:52] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:53] Filtrage du fichier de calcul sur trajectoires 14 trajectoires au lieu de 39 : 25 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des MSD filtré.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées filtré.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement filtré.
[27-01-2026 14:41:53] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:53] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:53] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:53] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:53] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144152.log
[27-01-2026 14:41:53] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144153.log
[27-01-2026 14:41:53] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:41:53] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:41:53] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:41:53] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:41:53] Localisation activée.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:41:53] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de localisation filtré
[27-01-2026 14:41:53] Tracking activé.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de trajectoires.
[27-01-2026 14:41:53] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:53] Filtrage du fichier de trajectoires 0 points au lieu de 455 : 455 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de trajectoires filtré
[27-01-2026 14:41:53] Reconnexion des trajectoires après scintillement.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de trajectoires reconnectées.
[27-01-2026 14:41:53] 455 point(s) trouvé(s).
[27-01-2026 14:41:53] Filtrage du fichier de trajectoires 0 points au lieu de 455 : 455 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de trajectoires filtré
[27-01-2026 14:41:53] Calcul sur les trajectoires activé.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des MSD.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des diffusions instantannées.
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:53] Filtrage du fichier de calcul sur trajectoires 0 trajectoires au lieu de 104 : 104 suppression(s)
[27-01-2026 14:41:53] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:41:53] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:41:53] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:41:53] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:41:53] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144153.log
Log Test : Add Color
[27-01-2026 14:41:53] Calcul sur les trajectoires à effectuer pour définir une couleur lors de la visualisation.
[27-01-2026 14:41:53] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
[27-01-2026 14:41:53] Aucune donnée de tracking calculée, aucun calcul supplémentaire ne peut être effectué.
[27-01-2026 14:41:53] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
[27-01-2026 14:41:53] Calcul sur les trajectoires à effectuer pour définir une couleur lors de la visualisation.
[27-01-2026 14:41:53] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:53] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
[27-01-2026 14:41:53] Calcul sur les trajectoires à effectuer pour définir une couleur lors de la visualisation.
[27-01-2026 14:41:53] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
[27-01-2026 14:41:53] Enregistrement du fichier de calcul des métriques de l'ajustement.
[27-01-2026 14:41:53] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
Processing Astigmatism3D
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Get Z From Planes |
✅ |
1ms |
Get Z From Step |
✅ |
1ms |
Sigma Model |
✅ |
1ms |
Model Validity |
✅ |
2ms |
Model Projection Validity |
✅ |
11ms |
Processing Gallery
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Make Gallery |
✅ |
6ms |
Processing Grapher
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Get Fig |
✅ |
353ms |
Blank |
✅ |
40ms |
Histogram |
✅ |
462ms |
Scatter |
✅ |
307ms |
Astigmatism3D Curve |
✅ |
60ms |
Processing Palm
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Palm Dll Valid |
✅ |
1ms |
Palm Cpu Image |
✅ |
598ms |
Palm Cpu Stack |
✅ |
3.14s |
Palm Cpu Stack Plane Selection |
✅ |
188ms |
Palm Cpu Stack Dll Check Quadrant |
✅ |
216ms |
Cpu Auto Threshold |
✅ |
27ms |
Tracking |
✅ |
4.70s |
Blinking Reconnection |
✅ |
168ms |
Tracks Compute |
✅ |
63ms |
Align |
✅ |
528ms |
Wavelett |
✅ |
34ms |
Astigmatism 3D Calibration |
✅ |
5ms |
Astigmatism 3D Estimation |
✅ |
7ms |
Log Test : Palm Cpu Image
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_0_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_1_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_2_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_3_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-0_103.6_True_4_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 51 Points comparés, 51 Points identiques (100.00%)
Log Test : Palm Cpu Stack
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_True_0_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 451 Points comparés, 451 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_True_1_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 451 Points comparés, 451 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_True_2_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 451 Points comparés, 451 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_True_3_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 451 Points comparés, 451 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_True_4_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 451 Points comparés, 451 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_False_0_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 429 Points comparés, 429 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_False_1_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 429 Points comparés, 429 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_False_2_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 429 Points comparés, 429 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_False_3_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 429 Points comparés, 429 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_False_4_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 429 Points comparés, 429 Points identiques (100.00%)
Log Test : Palm Cpu Stack Plane Selection
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-plane_select-103.6_True_4_1.0_0.0_7.csv'
Comparaison terminée : 227 Points comparés, 227 Points identiques (100.00%)
Log Test : Palm Cpu Stack Dll Check Quadrant
Comparaison terminée : 269 Points comparés, 269 Points identiques (100.00%)
Log Test : Tracking
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_0_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 224 Points comparés, 224 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_1_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 223 Points comparés, 223 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_2_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 225 Points comparés, 225 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_3_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 222 Points comparés, 222 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_True_4_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 222 Points comparés, 222 Points identiques (100.00%)
Fichier de localisations 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_True_5_1.0_0.0_7.csv' indisponible.
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_0_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 214 Points comparés, 214 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_1_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 212 Points comparés, 212 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_2_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 217 Points comparés, 217 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_3_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 211 Points comparés, 211 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-tracking-103.6_False_4_1.0_0.0_7-5_2_10_0.5.csv'
Comparaison terminée : 214 Points comparés, 214 Points identiques (100.00%)
Fichier de localisations 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\stack-localizations-103.6_False_5_1.0_0.0_7.csv' indisponible.
Log Test : Blinking Reconnection
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking-blinking-0.csv'
Comparaison terminée : 18 Points comparés, 18 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking-blinking-1.csv'
Comparaison terminée : 18 Points comparés, 18 Points identiques (100.00%)
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking-blinking-2.csv'
Comparaison terminée : 18 Points comparés, 18 Points identiques (100.00%)
Log Test : Tracks Compute
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-MSD-True.csv'
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-Fit-True.csv'
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-MSD-False.csv'
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-Fit-False.csv'
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-Fit-1.csv'
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-Fit-2.csv'
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Comparaison avec : 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\ref\tracking2-Fit-3.csv'
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Problème avec les identifiants des trajectoires, attention au filtrage
Processing Parsing
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Get Meta |
✅ |
3ms |
Get Max Point |
✅ |
1ms |
Rearrange Dataframe Columns |
✅ |
4ms |
Log10 Dataframe |
✅ |
4ms |
Parse Irregular Array |
✅ |
3ms |
Parse Result |
✅ |
14ms |
Parse Localization For Tracking |
✅ |
8ms |
Processing Visualization
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Normalize Data |
✅ |
1ms |
Render Hr Image |
✅ |
22ms |
Render Hr Image Bad Input |
✅ |
2ms |
Render Tracks Image |
✅ |
15ms |
Render Tracks Image Bad Input |
✅ |
3ms |
Render Roi |
✅ |
33ms |
Render Roi Bad Input |
✅ |
1ms |
Plot Histogram |
✅ |
861ms |
Plot Histogram Bad Input |
✅ |
121ms |
Plot Violin |
✅ |
650ms |
Plot Violin Bad Input |
✅ |
58ms |
Plot Heatmap |
✅ |
335ms |
Plot Heatmap Bad Input |
✅ |
56ms |
Settings Groups
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Base Group |
✅ |
120ms |
Batch |
✅ |
146ms |
Batch Get Path |
✅ |
196ms |
Batch Get Stacks |
✅ |
156ms |
Calibration |
✅ |
167ms |
Localization |
✅ |
209ms |
Gaussian Fit |
✅ |
147ms |
Spline Fit |
✅ |
115ms |
Tracking |
✅ |
127ms |
Gallery |
✅ |
108ms |
Visualization Hr |
✅ |
120ms |
Visualization Graph |
✅ |
107ms |
Filtering |
✅ |
130ms |
Filtering Gl |
✅ |
115ms |
Filtering T |
✅ |
119ms |
Tracks Blinking Reconnection |
✅ |
118ms |
Tracks Computes |
✅ |
110ms |
Log Test : Batch
- Activate : True
- Files : -1
- Mode : 0
{'Files': -1, 'Mode': 0}
Log Test : Batch Get Stacks
Error lors de la concatenation des piles (elles seront traité indépendamment):
ValueError: all the input array dimensions except for the concatenation axis must match exactly, but along dimension 1, the array at index 0 has size 128 and the array at index 1 has size 256
Log Test : Calibration
- Activate : True
- Pixel Size : 0.32
- Exposure : 0.05
- Intensity : 0.012
{'Pixel Size': 0.32, 'Exposure': 0.05, 'Intensity': 0.012}
Log Test : Localization
- Activate : True
- Preview : True
- Threshold : 90.0
- Auto Threshold : True
- ROI Shape : 0
- ROI Size : 7
- Watershed : True
- Fit : 0
- Gaussian Fit :
- Activate : True
- Mode : 0
- Sigma : 1.0
- Theta : 0.0
- Spline Fit :
- Activate : True
- Sensor : 0
- Variance Map :
- File :
{'Preview': True, 'Threshold': 90.0, 'Auto Threshold': True, 'ROI Shape': 0, 'ROI Size': 7, 'Watershed': True, 'Fit': 0, 'Gaussian Fit Mode': 0, 'Gaussian Fit Sigma': 1.0, 'Gaussian Fit Theta': 0.0, 'Spline Fit Sensor': 0, 'Spline Fit Variance Map': '', 'Spline Fit File': ''}
Log Test : Gaussian Fit
- Activate : True
- Mode : 2
- Sigma : 1.0
- Theta : 0.0
{'Mode': 2, 'Sigma': 1.0, 'Theta': 0.0}
Log Test : Spline Fit
- Activate : True
- Sensor : 1
- Variance Map :
- File :
{'Sensor': 1, 'Variance Map': '', 'File': ''}
Log Test : Tracking
- Activate : True
- Max Distance : 2.0
- Blinking Reconnection :
- Activate : False
- Mode : 0
- Max Duration : 1
- Max Speed : 1.0
{'Max Distance': 2.0, 'Blinking Reconnection Mode': 0, 'Blinking Reconnection Max Duration': 1, 'Blinking Reconnection Max Speed': 1.0}
Log Test : Gallery
- Activate : True
- ROI Size : 11
- ROIs Per Line : 30
{'ROI Size': 11, 'ROIs Per Line': 30}
Log Test : Visualization Hr
- Activate : True
- Ratio : 1
- Type : 0
- Source L : 1
- Source T : 1
{'Ratio': 1, 'Type': 0, 'Source L': 1, 'Source T': 1}
Log Test : Visualization Graph
- Activate : True
- Mode : 1
- Source : 0
{'Mode': 1, 'Source': 0}
Log Test : Filtering
- Activate : True
- Save : True
- Plane : [1, 100]
- Localization :
- Activate : True
- Intensity : [0, 100]
- Sigma X : [0.0, 1.0]
- Sigma Y : [0.0, 1.0]
- Circularity : [0.0, 1.0]
- Theta : [-1.0, 1.0]
- Z : [-1.0, 1.0]
- MSE XY : [0.0, 1.0]
- MSE Z : [0.0, 1.0]
- Tracks :
- Activate : True
- Length : [1, 100]
- Instant D : [-1.0, 1.0]
- D Coeff : [-1.0, 1.0]
- Alpha : [-1.0, 1.0]
- Speed : [0.0, 1.0]
- Confinement : [-1.0, 1.0]
{'Save': True, 'Plane': [1, 100], 'Localization Intensity': [0, 100], 'Localization Sigma X': [0.0, 1.0], 'Localization Sigma Y': [0.0, 1.0], 'Localization Circularity': [0.0, 1.0], 'Localization Theta': [-1.0, 1.0], 'Localization Z': [-1.0, 1.0], 'Localization MSE XY': [0.0, 1.0], 'Localization MSE Z': [0.0, 1.0], 'Tracks Length': [1, 100], 'Tracks Instant D': [-1.0, 1.0], 'Tracks D Coeff': [-1.0, 1.0], 'Tracks Alpha': [-1.0, 1.0], 'Tracks Speed': [0.0, 1.0], 'Tracks Confinement': [-1.0, 1.0]}
Log Test : Filtering Gl
- Activate : True
- Intensity : [2, 9]
- Sigma X : [0.0, 1.0]
- Sigma Y : [0.0, 1.0]
- Circularity : [0.0, 1.0]
- Theta : [-1.0, 1.0]
- Z : [-1.0, 1.0]
- MSE XY : [0.0, 1.0]
- MSE Z : [0.0, 1.0]
{'Intensity': [2, 9], 'Sigma X': [0.0, 1.0], 'Sigma Y': [0.0, 1.0], 'Circularity': [0.0, 1.0], 'Theta': [-1.0, 1.0], 'Z': [-1.0, 1.0], 'MSE XY': [0.0, 1.0], 'MSE Z': [0.0, 1.0]}
Log Test : Filtering T
- Activate : True
- Length : [2, 3]
- Instant D : [-1.0, 1.0]
- D Coeff : [-1.0, 1.0]
- Alpha : [-1.0, 1.0]
- Speed : [0.0, 1.0]
- Confinement : [-1.0, 1.0]
{'Length': [2, 3], 'Instant D': [-1.0, 1.0], 'D Coeff': [-1.0, 1.0], 'Alpha': [-1.0, 1.0], 'Speed': [0.0, 1.0], 'Confinement': [-1.0, 1.0]}
Log Test : Tracks Blinking Reconnection
- Activate : True
- Mode : 1
- Max Duration : 1
- Max Speed : 1.0
{'Mode': 1, 'Max Duration': 1, 'Max Speed': 1.0}
Log Test : Tracks Computes
- Activate : True
- MSD : True
- Instant Diffusion : False
- Fit Length : 4
- 3D : False
- Log Scale : False
- Fit : 0
{'MSD': True, 'Instant Diffusion': False, 'Fit Length': 4, '3D': False, 'Log Scale': False, 'Fit': 0}
Settings Settings
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Settings |
✅ |
153ms |
Settings Group Getter |
✅ |
122ms |
Settings Signal |
✅ |
135ms |
Log Test : Settings
Settings :
- Batch :
- Activate : True
- Files : -1
- Mode : 0
- Calibration :
- Activate : True
- Pixel Size : 0.32
- Exposure : 0.05
- Intensity : 0.012
- Localization :
- Activate : False
- Preview : False
- Threshold : 90.0
- Auto Threshold : True
- ROI Shape : 0
- ROI Size : 7
- Watershed : True
- Fit : 0
- Gaussian Fit :
- Activate : True
- Mode : 0
- Sigma : 1.0
- Theta : 0.0
- Spline Fit :
- Activate : True
- Sensor : 0
- Variance Map :
- File :
- Tracking :
- Activate : False
- Max Distance : 1.0
- Blinking Reconnection :
- Activate : False
- Mode : 0
- Max Duration : 1
- Max Speed : 1.0
- TracksCompute :
- Activate : False
- MSD : False
- Instant Diffusion : False
- Fit Length : 4
- 3D : False
- Log Scale : False
- Fit : 0
- Gallery :
- Activate : False
- ROI Size : 9
- ROIs Per Line : 30
- VisualizationHR :
- Activate : False
- Ratio : 2
- Type : 0
- Source L : 1
- Source T : 1
- VisualizationGraph :
- Activate : False
- Mode : 0
- Source : 0
- Filtering :
- Activate : True
- Save : False
- Plane : [1, 100]
- Localization :
- Activate : True
- Intensity : [0, 100]
- Sigma X : [0.0, 1.0]
- Sigma Y : [0.0, 1.0]
- Circularity : [0.0, 1.0]
- Theta : [-1.0, 1.0]
- Z : [-1.0, 1.0]
- MSE XY : [0.0, 1.0]
- MSE Z : [0.0, 1.0]
- Tracks :
- Activate : True
- Length : [1, 100]
- Instant D : [-1.0, 1.0]
- D Coeff : [-1.0, 1.0]
- Alpha : [-1.0, 1.0]
- Speed : [0.0, 1.0]
- Confinement : [-1.0, 1.0]
Settings Signal
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Connect And Emit Direct |
✅ |
1ms |
Disconnect |
✅ |
1ms |
Block Simple Coalescence Last Value |
✅ |
1ms |
Block Without Emits No Output |
✅ |
1ms |
Nested Blocks Emit Once At Outer Exit |
✅ |
1ms |
Emit Default None Coalesced |
✅ |
1ms |
Block Flags Reset After Flush |
✅ |
1ms |
Blocked Returns Context Manager Instance |
✅ |
1ms |
Internal Block Begin End Paths |
✅ |
1ms |
Coalescence Overwrite Multiple Times |
✅ |
1ms |
Emit Direct After Previous Block |
✅ |
1ms |
Settings Types
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Base Setting |
✅ |
1ms |
Create Setting From Dict |
✅ |
473ms |
Create Setting From Dict Fail |
✅ |
119ms |
Spin Int |
✅ |
105ms |
Spin Float |
✅ |
113ms |
Check Box |
✅ |
106ms |
Combo |
✅ |
115ms |
Browse File |
✅ |
103ms |
File List |
✅ |
117ms |
Check Range Int |
✅ |
103ms |
Check Range Float |
✅ |
115ms |
Button |
✅ |
103ms |
Tools Fileio
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Save Json |
✅ |
1ms |
Open Json |
✅ |
1ms |
Open Json Bad File |
✅ |
1ms |
Save Tif |
✅ |
3ms |
Save Tif 2D |
✅ |
2ms |
Save Tif Bad Stack |
✅ |
1ms |
Open Tif |
✅ |
9ms |
Open Tif Bad File |
✅ |
1ms |
Save Png |
✅ |
6ms |
Save Png Color |
✅ |
9ms |
Save Png Bad Sample |
✅ |
1ms |
Open Calibration Mat Bad File |
✅ |
1ms |
Open Calibration Mat |
✅ |
28ms |
Log Test : Open Calibration Mat
{'dz': np.uint8(10), 'coeff': array([[[[ 1.76262995e-03, 6.60182966e-04, 1.75444511e-04, ...,
-7.81234667e-06, 8.00063481e-06, -2.51688152e-06],
[ 1.75704551e-03, 6.45794673e-04, 1.96373905e-04, ...,
-7.81234667e-06, 8.00063572e-06, -2.51688152e-06],
[ 1.74238149e-03, 6.11375668e-04, 2.48690136e-04, ...,
-5.07905042e-07, -5.15571901e-06, 1.83311408e-06],
[ 1.71448046e-03, 6.15136058e-04, 2.82197463e-04, ...,
3.08603285e-06, 3.93476876e-06, -1.32345281e-06],
[ 1.68601575e-03, 6.72109716e-04, 2.53685779e-04, ...,
-1.85213310e-06, 3.18481398e-06, -5.18025331e-07],
[ 1.67045288e-03, 7.41014606e-04, 1.85979850e-04, ...,
-1.85213310e-06, 3.18481398e-06, -5.18025331e-07]],
[[ 2.70473980e-03, -9.48156667e-05, 1.01578154e-03, ...,
-7.81234667e-06, 8.00063572e-06, -2.51688152e-06],
[ 2.70959642e-03, -1.02119076e-04, 1.03564339e-03, ...,
-7.81234667e-06, 8.00063572e-06, -2.51688152e-06],
[ 2.71256035e-03, -8.98670405e-05, 1.04932650e-03, ...,
-5.07905042e-07, -5.15571901e-06, 1.83311408e-06],
[ 2.70262384e-03, -1.70290077e-05, 1.01669191e-03, ...,
3.08603285e-06, 3.93476876e-06, -1.32345281e-06],
[ 2.69394857e-03, 1.13344904e-04, 9.06467263e-04, ...,
-1.85213310e-06, 3.18481398e-06, -5.18025331e-07],
[ 2.69722054e-03, 2.37507324e-04, 7.71025720e-04, ...,
-1.85213310e-06, 3.18481398e-06, -5.18025331e-07]],
[[ 3.56831495e-03, -4.40529606e-04, 1.41770788e-03, ...,
9.90122135e-06, -7.44254885e-06, 2.23133543e-06],
[ 3.59475426e-03, -4.64643032e-04, 1.46338262e-03, ...,
9.90122135e-06, -7.44254885e-06, 2.23133543e-06],
[ 3.66876321e-03, -4.95911052e-04, 1.53967657e-03, ...,
-3.95631878e-06, 1.27160592e-05, -3.91617095e-06],
[ 3.76045704e-03, -4.57936869e-04, 1.55345595e-03, ...,
8.09040648e-06, -2.39337242e-05, 6.82765040e-06],
[ 3.84947704e-03, -3.24017310e-04, 1.45022175e-03, ...,
4.05997935e-06, -7.87759382e-06, 1.60339005e-06],
[ 3.93907167e-03, -1.99005764e-04, 1.31643086e-03, ...,
4.05997935e-06, -7.87759382e-06, 1.60339005e-06]],
...,
[[ 2.42101937e-03, 8.45823204e-04, 2.58160017e-05, ...,
-1.51463273e-05, 1.15915709e-05, -2.29856619e-06],
[ 2.43261014e-03, 8.29919532e-04, 3.14000754e-05, ...,
-1.51463273e-05, 1.15915709e-05, -2.29856619e-06],
[ 2.46658362e-03, 7.86881545e-04, 6.60509904e-05, ...,
-1.63374498e-05, 6.06615640e-06, -8.61550902e-08],
[ 2.49986164e-03, 7.28350074e-04, 1.45897924e-04, ...,
5.97384405e-06, -3.04068908e-06, 6.25882933e-07],
[ 2.52369908e-03, 6.22923486e-04, 2.85503629e-04, ...,
1.95473440e-05, -2.00541726e-05, 4.52503036e-06],
[ 2.53130752e-03, 4.63657198e-04, 4.77367372e-04, ...,
1.95473440e-05, -2.00541726e-05, 4.52503036e-06]],
[[ 2.46633077e-03, 9.78531549e-04, -2.31912054e-04, ...,
1.37966417e-05, -9.95016126e-06, 1.74210243e-06],
[ 2.46035471e-03, 9.55297786e-04, -2.44177354e-04, ...,
1.37966417e-05, -9.95016126e-06, 1.74210243e-06],
[ 2.42791767e-03, 9.01909196e-04, -2.63140537e-04, ...,
1.22992269e-05, -7.90170816e-06, 1.20454467e-06],
[ 2.35864520e-03, 8.85267160e-04, -3.00246233e-04, ...,
-1.18684829e-06, -2.77304537e-07, 1.98907600e-07],
[ 2.28697783e-03, 8.83703528e-04, -3.15127894e-04, ...,
-3.88470380e-06, 2.21625555e-06, -2.01877484e-07],
[ 2.24619033e-03, 8.52560741e-04, -2.84196023e-04, ...,
-3.88470380e-06, 2.21625555e-06, -2.01877484e-07]],
[[ 2.24976288e-03, 6.56987599e-04, -1.60009586e-04, ...,
1.37966417e-05, -9.95016126e-06, 1.74210243e-06],
[ 2.25791475e-03, 7.09359127e-04, -2.15561231e-04, ...,
1.37966417e-05, -9.95016126e-06, 1.74210243e-06],
[ 2.27287575e-03, 8.60852888e-04, -3.72661190e-04, ...,
1.22992269e-05, -7.90170816e-06, 1.20454467e-06],
[ 2.26707128e-03, 1.06072903e-03, -5.67374227e-04, ...,
-1.18684829e-06, -2.77304537e-07, 1.98907600e-07],
[ 2.26142514e-03, 1.22725707e-03, -7.24507263e-04, ...,
-3.88470380e-06, 2.21625555e-06, -2.01877498e-07],
[ 2.27620034e-03, 1.31491164e-03, -8.16303713e-04, ...,
-3.88470380e-06, 2.21625555e-06, -2.01877484e-07]]],
[[[ 2.50432733e-03, 7.29281281e-04, -1.06346182e-04, ...,
6.38279914e-07, 4.49990921e-07, -2.51688152e-06],
[ 2.50045164e-03, 7.42255477e-04, -9.99131153e-05, ...,
6.38279914e-07, 4.49990921e-07, -2.51688152e-06],
[ 2.49238522e-03, 7.78569840e-04, -8.14959785e-05, ...,
-5.32000104e-06, 3.43623128e-07, 1.83311408e-06],
[ 2.49468768e-03, 8.28152406e-04, -6.91811219e-05, ...,
6.98521126e-06, -3.55899736e-08, -1.32345281e-06],
[ 2.50335736e-03, 8.54119193e-04, -7.16763170e-05, ...,
2.96341909e-06, 1.63073810e-06, -5.18025331e-07],
[ 2.50790780e-03, 8.44355556e-04, -8.26389223e-05, ...,
2.96341909e-06, 1.63073810e-06, -5.18025331e-07]],
[[ 3.34816240e-03, 1.10411760e-03, 1.83151744e-04, ...,
6.38279914e-07, 4.49990893e-07, -2.51688152e-06],
[ 3.35706770e-03, 1.11100858e-03, 1.77484195e-04, ...,
6.38279914e-07, 4.49990893e-07, -2.51688152e-06],
[ 3.37493583e-03, 1.11753412e-03, 1.58074618e-04, ...,
-5.32000104e-06, 3.43623128e-07, 1.83311408e-06],
[ 3.40374932e-03, 1.12074276e-03, 1.21079844e-04, ...,
6.98521126e-06, -3.55899701e-08, -1.32345281e-06],
[ 3.43565480e-03, 1.09196187e-03, 7.21496835e-05, ...,
2.96341909e-06, 1.63073810e-06, -5.18025331e-07],
[ 3.45852808e-03, 1.03788241e-03, 2.93494068e-05, ...,
2.96341909e-06, 1.63073810e-06, -5.18025331e-07]],
[[ 4.15255735e-03, 1.21607853e-03, 2.38900349e-04, ...,
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1.97192003e-06, 1.71042245e-07, -1.61690014e-06],
[ 3.31157236e-03, -7.51926040e-04, -5.00304624e-04, ...,
1.86037437e-06, -2.79883648e-06, -3.34185188e-06],
[ 3.22864158e-03, -8.45583738e-04, -4.23668127e-04, ...,
1.33423064e-05, -4.04343973e-06, -6.14766986e-06],
[ 3.10671143e-03, -9.51123657e-04, -3.31630086e-04, ...,
-1.40128054e-06, 1.12709210e-06, 1.95759048e-06],
[ 2.99397111e-03, -1.01274089e-03, -2.58435670e-04, ...,
-1.40128054e-06, 1.12709210e-06, 1.95759048e-06]],
[[ 3.06666549e-03, -1.13794627e-03, -3.47808993e-04, ...,
1.97192003e-06, 1.71042245e-07, -1.61690014e-06],
[ 3.07110650e-03, -1.13720901e-03, -3.47641093e-04, ...,
1.97192003e-06, 1.71042245e-07, -1.61690014e-06],
[ 3.07030417e-03, -1.12003589e-03, -3.41904379e-04, ...,
1.86037437e-06, -2.79883648e-06, -3.34185188e-06],
[ 3.03534791e-03, -1.07207801e-03, -3.28305468e-04, ...,
1.33423064e-05, -4.04343973e-06, -6.14766986e-06],
[ 2.93844682e-03, -9.94288479e-04, -3.13063589e-04, ...,
-1.40128054e-06, 1.12709210e-06, 1.95759048e-06],
[ 2.83285952e-03, -9.21817904e-04, -2.96976737e-04, ...,
-1.40128054e-06, 1.12709210e-06, 1.95759048e-06]]]],
shape=(14, 14, 6, 64))}
(14, 14, 6, 64)
Tools Filemigrator
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Open |
✅ |
3ms |
Update Meta |
✅ |
3ms |
Open Old File |
✅ |
4ms |
Open Old Irregular File |
✅ |
3ms |
Column Migrator |
✅ |
2ms |
Analyze |
✅ |
2ms |
Migrate |
✅ |
228ms |
Log Test : Analyze
.
Log Test : Migrate
No localization file in folder.
No tracking file in folder.
No MSD file in folder.
No Instant Diffusion file in folder.
No Fit file in folder.
No Astimagmatism 3D Model file in folder.
Localization file migrated.
Warning that the 'Height' metadata differs between several files to be migrated (128 VS 256). The first one (128) will be retained.
Tracking file migrated.
MSD file migrated.
Instant Diffusion file migrated.
Fit file migrated.
Astimagmatism 3D Model file migrated.
Tools Logger
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Logger |
✅ |
2ms |
Logger Bad Use |
✅ |
1ms |
Log Test : Logger
[27-01-2026 14:42:11] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\output/test_logger.log
[27-01-2026 14:42:11] First message
[27-01-2026 14:42:11]
[27-01-2026 14:42:11] after blank
[27-01-2026 14:42:11] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\output/test_logger.log
Log Test : Logger Bad Use
[27-01-2026 14:42:11] Aucun fichier à fermer.
[27-01-2026 14:42:11] Message without logger open
[27-01-2026 14:42:11] Aucun fichier de log ouvert pour écrire.
Tools Monitoring
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Monitoring |
✅ |
1.24s |
Monitoring Save |
✅ |
6.64s |
Log Test : Monitoring
6 entrées.
Timestamps : [0.0, 0.21, 0.42, 0.64, 0.86, 1.02]
CPU Usage : [0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.41875, 0.0]
GPU Usage : [0, 0, 0, 0, 0, 2]
Memory Usage : [620.53125, 620.53125, 620.53125, 620.53125, 620.53125, 620.55859375]
Disk Usage : [0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0]
Log Test : Monitoring Save
Simulating high CPU usage for 2 seconds...
CPU simulation complete.
Aucun GPU CUDA disponible pour la simulation.
Allocating 50 MB of memory...
Memory allocated. Holding for 2 seconds...
Releasing memory.
Writing a file of size 1 MB...
File written. Holding for 2 seconds...
Deleting the file...
Disk I/O simulation complete.
Kaleido doesn't work so well need update. No Image Saved.
Tools Utils
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Add Extension |
✅ |
1ms |
Add Suffix |
✅ |
1ms |
Get Timestamp For Files |
✅ |
1ms |
Get Last File |
✅ |
3ms |
Extract Suffix |
✅ |
1ms |
Load Dll |
✅ |
2ms |
Print Error |
✅ |
1ms |
Print Warning |
✅ |
2ms |
Print Success |
✅ |
2ms |
Format Time |
✅ |
1ms |
Log Test : Get Timestamp For Files
Timestamp with hour : 20260127_144219
Timestamp without hour : 20260127
Log Test : Get Last File
C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\File-03.txt
C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input\File-03.txt
Log Test : Load Dll
Impossible de charger la DLL 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\DLL\PALMTracer_File.dll':
Could not find module 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\DLL\PALMTracer_File.dll' (or one of its dependencies). Try using the full path with constructor syntax.
Log Test : Print Error
Message d'erreur
Log Test : Print Warning
Message d'avertissement
Log Test : Print Success
Message de succes
Ui Alignmentwidget
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
10ms |
Bad Load Tif |
✅ |
27ms |
Bad Load Coef |
✅ |
13ms |
Bad Compute |
✅ |
11ms |
Compute |
✅ |
12ms |
Bad Align |
✅ |
7ms |
Align |
✅ |
159ms |
Ui Astigmatism3Dwidget
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
351ms |
Bad Load Loc |
✅ |
106ms |
Bad Load Model |
✅ |
82ms |
Bad Compute |
✅ |
110ms |
Compute |
✅ |
203ms |
Compute Z |
✅ |
194ms |
Bad Estimate |
✅ |
107ms |
Estimate |
✅ |
197ms |
Estimate Backup |
✅ |
191ms |
Sync Spin |
✅ |
116ms |
Download |
✅ |
153ms |
Ui Filemigratorwidget
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
5ms |
Bad Load |
✅ |
7ms |
Mirgate |
✅ |
28ms |
Ui Graphviewer
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
155ms |
Actualize |
✅ |
842ms |
Reset Filtered |
✅ |
379ms |
Update Filtered |
✅ |
497ms |
Update Plot |
✅ |
682ms |
Get Plot Data |
✅ |
891ms |
Status |
✅ |
158ms |
Tracks Source |
✅ |
176ms |
Ui Standalonewidget
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
2ms |
Widget
Test Name |
Status |
Duration |
|---|---|---|
Widget Creation |
✅ |
1.18s |
Widget On Load Setting |
✅ |
712ms |
Widget Reset Setting |
✅ |
913ms |
Widget Reset Layer |
✅ |
1.43s |
Widget Get Actual Image |
✅ |
1.45s |
Widget Add Detection Layers |
✅ |
7.22s |
Widget Preview |
✅ |
7.04s |
Widget Auto Threshold |
✅ |
1.51s |
Widget Thread Process |
✅ |
1.56s |
Widget After Close |
✅ |
1.60s |
Viewer3D |
✅ |
2.05s |
Viewerhr Load |
✅ |
890ms |
Viewerhr Generate |
✅ |
5.44s |
Viewerhr Already Configured |
✅ |
2.52s |
Log Test : Widget On Load Setting
INFO: Chargement du fichier de configuration '.'.
WARNING: Erreur lors du chargement du fichier '.' : Le fichier "." est introuvable.
Log Test : Widget Reset Layer
INFO: Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Log Test : Widget Get Actual Image
INFO: Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Log Test : Widget Add Detection Layers
erreur lors de la suppression de l'ancien calque : Using glBindFramebuffer with no OpenGL context.
Log Test : Widget Preview
INFO: Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
INFO: Thread Process done
Preview des 142 points détectés (46 sur l'image actuelle, 48 sur l'image précédente, 48 sur l'image suivante).
INFO: Thread Process done
Preview des 142 points détectés (46 sur l'image actuelle, 48 sur l'image précédente, 48 sur l'image suivante).
Erreur lors de la suppression de l'ancien calque : Using glBindFramebuffer with no OpenGL context.
INFO: Thread Process done
Log Test : Widget Auto Threshold
INFO: Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Auto Threshold : 63.95
Log Test : Widget Thread Process
INFO: Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
INFO: Thread Process done
[27-01-2026 14:42:48] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144248.log
[27-01-2026 14:42:48] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:42:48] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:42:48] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:42:48] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:42:48] Localisation désactivé.
[27-01-2026 14:42:48] Aucune donnée de localisation pré-calculée.
[27-01-2026 14:42:48] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:42:48] Aucune donnée de tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:42:48] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:42:48] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:42:48] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:42:48] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:42:48] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:42:48] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144248.log
INFO: Thread Process done
Auto Threshold : 63.95
INFO: Thread Process done
Log Test : Widget After Close
INFO: Chargement du fichier de configuration 'C:\Users\tmonseigne\.palm_tracer\settings.json'.
INFO: Loaded C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack.tif into Napari viewer.
Log Test : Viewer3D
WARNING: Le fichier doit contenir les colonnes X, Y, Z et Integrated Intensity.
WARNING: erreur lors de la suppression de l'ancien calque : Using glBindFramebuffer with no OpenGL context.
Log Test : Viewerhr Already Configured
[27-01-2026 14:42:59] Log ouvert : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144259.log
[27-01-2026 14:42:59] Commencer le traitement.
[27-01-2026 14:42:59] Dossier de sortie : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer
[27-01-2026 14:42:59] Paramètres sauvegardés.
[27-01-2026 14:42:59] Fichier Meta sauvegardé.
[27-01-2026 14:42:59] Localisation activée.
[27-01-2026 14:42:59] Enregistrement du fichier de localisation
[27-01-2026 14:42:59] 455 localisation(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:42:59] Tracking désactivé.
[27-01-2026 14:42:59] Chargement d'un tracking pré-calculée.
[27-01-2026 14:42:59] Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\tracking-20260127_144253.csv' chargé avec succès.
[27-01-2026 14:42:59] 455 trajectoire(s) trouvée(s).
[27-01-2026 14:42:59] Calcul sur les trajectoires désactivé.
[27-01-2026 14:42:59] Visualisation haute résolution désactivée.
[27-01-2026 14:42:59] Visualisation graphique désactivée.
[27-01-2026 14:42:59] Génération de la galerie désactivée.
[27-01-2026 14:42:59] Traitement terminé.
[27-01-2026 14:42:59] Log fermé : C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/log-20260127_144259.log
Chargement du fichier de configuration 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer\settings-20260127_144259.json'.
Fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/localizations-20260127_144259.csv' chargé avec succès.
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/localizations_filtered-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/localizations_filtered-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking-reconnected-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking-reconnected-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered_reconnected-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_filtered_reconnected-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_MSD-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD_filtered-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_InstantD_filtered-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit-20260127_144259.csv'
Erreur lors du chargement du fichier 'C:\Git\palm-tracer\palm_tracer\_tests\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit_filtered-20260127_144259.csv' : [Errno 2] No such file or directory: 'C:\\Git\\palm-tracer\\palm_tracer\\_tests\\input/stack_PALM_Tracer/tracking_Fit_filtered-20260127_144259.csv'
Pile chargé avec succès (taille : (10, 128, 256)).
INFO: Sauvegarde du fichier image.